2012年，美国斯坦福大学Markus W. Covert团队发布了全球首个全细胞计算模型，成功模拟了支原体（Mycoplasma genitalium）的全部生物过程，涵盖基因表达、能量代谢、细胞周期等。 而到了2010年代，人工智能特别是深度学习技术突飞猛进，成为虚拟细胞背后的强大引擎。