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生物通报道:RNA-Seq技术,能够进行大规模的转录组分析,从而彻底改变了基因组未测序物种的研究。 为了研究这些转录组,首先我们要通过从头转录组组装确定一组转录本序列,利用RNA-Seq读取数据重建转录本序列,无需基因组序列信息的帮助。
编辑推荐: 针对单细胞RNA测序 (scRNA-seq)数据标准化和批量RNA-seq解卷积中因忽略转录组大小差异导致的基因表达偏差问题,Songjian Lu等开发了ReDeconv算法。该工具通过CLTS(基于线性化转录组大小的计数)标准化方法,有效校正了CP10K标准化导致的差异表达基因误识别,并整合表达方差信息提升了解卷积 ...
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生物信息学习的正确姿势 之前整理的一篇大综述 — Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这 收到了 热烈 反响,阅读人数过万。 行文很长 ...