CTCF 与染色质可及性的关系：CTCF 结合会降低染色质的可及性，且这种降低依赖于 cohesin。 在野生型和突变型 CTCF 结合位点，可及性均在 SMC3（cohesin 的一个亚基）存在时降低，且不同突变体降低可及性的能力存在差异，表明 CTCF 与可及性之间存在双向关系。

结合 CTCF 突变探秘染色质调控机制：解锁基因表达与疾病关联密码 《Cell Genomics》：Binding domain mutations provide insight into CTCF’s relationship with chromatin and its contribution to gene regulation 【字体： 大 中 小 】 时间：2025年03月21日 ...

TEs序列中往往存在大量转录因子结合位点。 在小鼠基因组中，约28%的CTCF结合位点存在于TEs序列中。 小鼠胚胎干细胞的研究显示，神经保护蛋白ADNP在SINE B2衍生的CTCF结合位点上同CTCF存在竞争性抑制关系。

研究揭示三维基因组拓扑相关结构域边界的CTCF组织规律 来源：网络 2023-12-17 10:13 该研究首次解析了三维基因组TAD边界处朝向TAD外CTCF位点的重要生物 ...

而CTCF作为关键染色质架构蛋白，与染色质高级结构的建立和维持密切相关。

他们通过考虑CTCF结合的环形潜力（由环形关联的DeepAnchor模型预测的锚得分），对此前的一个环竞争和挤压模型（loop competition and extrusion model, LEM)中的CTCF结合概率进行加权，得出了一个新的实现——LoopAnchor。

Nature：揭示黏连蛋白、CTCF和DNA张力在染色体空间组装中的作用 细胞分裂 黏连蛋白 CTCF DNA环 来源：生物谷原创 2023-04-26 10:45 在一项新的研究中，来自 ...

并通过整合分析HiChIP、ChIP-seq和RNA-seq数据，系统地表征了前列腺癌中各种基因组调控区域的相互作用。 通过CRISPR敲除MYC基因上游的CTCF位点并联合H3K27ac、AR和CTCF的HiChIP结果，发现MYC激活会导致CTCF介导的染色质loop发生明显改变。

真核生物基因组DNA缠绕在组蛋白八聚体上形成染色质，并在染色质架构蛋白的作用下逐级折叠形成远距离的染色质相互作用（或染色质环）、拓扑相关结构域和染色质区室等染色质高级结构。远距离染色质互作可以调控基因表达，在细胞命运决定过程中具有关键作用。CCCTC结合因子（简称CTCF）最早被 ...

图5 CTCF在抑制BLCAP表达方面的作用的功能验证 六、多组学联合揭示CTCF共同调控因子 为了进一步研究急性CTCF耗竭对基因表达的影响，本文系统探索了CTCF介导的下游蛋白组和磷酸化蛋白组水平的基因表达，并将其与ATAC-seq和RNA-seq数据联合分析 (图6A)。