大数据时代下微生物组学的发展迎来了新的机遇与挑战,因此我们开发了Dix-seq以便于用户处理扩增子测序数据。测试结果表明Dix-seq的综合性能基本上略强或持平当前主流的扩增子测序数据分析软件,而且其 部署方便 , 使用简单 , 可拓展性强 ...
多态性信息含量(PIC)值介于 0.250(umc2334)到 0.730(phi034)之间,平均值为 0.521。通过非加权组平均法(UPGMA)算法,将基因型分为两个主要聚类,而邻接法分析则划分出三个主要聚类。结构分析将基因型分为两个亚群。有 15 个基因型(DQL-609–1-3、DQL-774–171 ...
在数据分析方面,借助 GenAlEx v.6.5 和 PowerMarker v.3.25 软件计算遗传多样性参数,运用 MEGAX 软件的 UPGMA 算法进行聚类分析,利用 STRUCTURE v.2.3.4 软件进行种群结构研究,通过 Arlequin v.3.5 软件进行分子方差分析(AMOVA)。 研究结果 SSR 标记的遗传多样性:研究发现 ...