在毒理学研究中，转录组基准浓度（BMC）建模对化学品风险评估意义重大。研究人员对比微阵列和 RNA-seq 在大麻二酚（CBC）和大麻酚（CBN）浓度响应转录组研究中的表现。结果显示二者整体基因表达模式相似，功能分析和 BMC 建模等效。该研究为转录组研究方法 ...

福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本蕴含丰富临床信息，但对其进行单细胞或单核 RNA（sc/snRNA）分析颇具挑战。研究人员开发了 snRandom-seq 技术，该技术能有效从 FFPE 样本中捕获全 RNA，降低双细胞率，提升检测能力，为研究复杂生物系统提供有力工具。 福尔马林 ...

一般而言就用默认的，作者也是这样认为的。-i id attribute: 在GTF文件的最后一栏里，会有这个基因的多个命名方式（如下）， RNA-Seq数据分析常用的是gene_id， 当然你可以写一个脚本替换成其他命名方式。 gene_id "ENSG00000223972.5_2"; transcript_id "ENST00000456328.2_1"; gene_type ...

中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组揭示了双链RNA依赖的蛋白激酶R（PKR）在阿尔茨海默病（AD）发生与进展过程中异常激活的分子病理特征，开发了基于具有分子内短双链结构环形RNA（ds-cRNA）抑制PKR异常激活的策略。 AD是以淀粉样蛋白（Aβ ...