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为解决高变异病毒基因组测序和qPCR引物设计难题,研究人员开发了生物信息学命令行工具varVAMP。该工具基于多序列比对(MSA),通过简并引物设计优化覆盖率和错配最小化,成功应用于SARS-CoV-2、HEV、HAV等病毒的全基因组测序和qPCR检测。研究证明varVAMP在引物错 ...
现有微生物组研究多未报告原核生物绝对丰度,易误读相对丰度数据。为解决此问题,研究人员开发通过 qPCR 或数字 droplet PCR(ddPCR)对粪便样本中原核生物浓度进行严谨且可重复定量的详细方案,可输出每克粪便的 16S rRNA 拷贝数,兼具敏感性与简便性。
什么是实时荧光定量PCR (RT-PCR,qPCR)? 实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)指的是在PCR进行的同时,对其过程进行监测的能力(即实时)。因此,数据可在PCR扩增过程中,而非PCR结束之后,进行收集。这为基于PCR的DNA和RNA定量方法带来了革命性的变革。在实时 ...
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