多方的阻力，让宗馥莉在接班的过程中还闹出辞职的小插曲。据网络流传的“致娃哈哈集团全体员工的函”中所述，原因是娃哈哈集团部分股东对宗馥莉自宗庆后董事长离世后对娃哈哈集团经营管理的合理性提出质疑，致使宗馥莉无法继续履行对娃哈哈集团及其持股公司的管理职责。