蒋介石此时则对国民党内的异己力量更为敏感，特别是美国所属意的人物，蒋必欲去之，这几乎已成为规律。吴国桢、孙立人的下场是最典型的例子。蒋介石为换取美援打内战，出让了不少主权，唯独对人事权决不放松，最终使美国在人事上的企图无法实现。

1949年12月，蒋介石最终宣布正式退守台湾。国民党政府撤离时，总共带走了大约60万陆军，3万5千海军，以及50余艘舰艇和400多架战机。这样的军事和物资储备，虽然显示了蒋介石依旧抱有强烈的反攻信念，但历史已注定，他的反攻梦想注定无法实现。