自二十世纪九十年代中期以来,芯片就一直是基因组表达分析的中坚力量。不过随着测序成本的直线下降,RNA测序(RNA-seq)成为了越来越受欢迎的转录组分析方法。The Scientist杂志与多位专家共同探讨了从芯片到RNA-seq的过渡,希望帮助研究者们顺利度过这段艰难 ...
【导读】外转录组修饰,尤其是N6-甲基腺苷(m6A),是基因表达的关键调控因子,影响着RNA的稳定性、剪接和翻译等过程。从Nanopore直接RNA测序(DRS)数据中检测m6A的传统计算方法受限于对实验验证标签的依赖,往往会导致对修饰位点的低估。在 ...
引言近年来,单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)在揭示复杂生物系统和探索遗传学及临床研究中取得了突破性进展。然而,仅依赖单一的转录组信息往往难以区分分子相似但功能差异显著的细胞类别。因此,融合多种模态信息的单细胞测序技术逐渐成为研究热点,通过同时获取单个细胞的多维数据,研究人员能够更全面地解析细胞状态及其 ...
单细胞测序技术经过了10余年的发展,取得了众多的技术进展与突破。其中,单细胞RNA测序技术中,Smart-Seq方法以其可实现完整mRNA扩增的优势,被广泛的应用。而近期广受关注的另外一个高通量单细胞RNA测序技术由Macosko E团队开发,其研究成果于2015年发表在 ...