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为解决 DNA 甲基化与基因表达关系研究中存在的问题,研究人员开展了利用深度学习构建 DeepMethyGene 模型预测基因表达的研究。结果显示,该模型预测性能优异,优于 geneEXPLORE 模型。这为疾病进展预测和临床干预提供了理论支持。
2024年11月,研究人员在Science上发表了一项研究Evo 1,基于单细胞(270万个原核生物和噬菌体)基因组进行训练,具有70亿个参数,在单核苷酸(构成DNA或RNA的基本单元)设置下实现了13万碱基的上下文长度。
在生命科学领域,人工智能(AI)正逐渐展现出巨大的潜力,为科研带来前所未有的突破。近日,美国Arc研究所与NVIDIA公司、斯坦福大学和加州大学伯克利分校等机构合作,发布了迄今为止最大的公开可用生物学AI模型Evo ...
随着蛋白质数据库的不断丰富和机器学习(ML)技术的飞速发展,利用计算方法预测 DNA 结合蛋白和结合残基成为了新的研究方向。但现有的机器学习方法大多依赖于多序列比对(MSA)得到的进化特征,如位置特异性得分矩阵(PSSM)和隐马尔可夫模型(HMM ...
2024年11月,研究人员在Science上发表了一项研究Evo 1,基于单细胞(270万个原核生物和噬菌体)基因组进行训练,具有70亿个参数,在单核苷酸(构成DNA或RNA的基本单元)设置下实现了13万碱基的上下文长度。 Evo 1论文链接:https://www.science.org/doi/10.1126/science.ado9336 Evo 1在DNA、RNA ...
来自MSN5 个月
大模型重构生命科学!最大基础模型面世,解锁DNA超长序列就在当下,在第三届中国生物计算大会上,全球规模最大的生命科学基础模型横空出世—— xTrimo V3,参数规模高达2100亿,覆盖蛋白质、DNA、RNA ...
一项基于大量遗传数据的人工智能模型能够预测细菌是否会产生抗生素抗药性。最新研究表明,抗生素抗药性在遗传相似的细菌之间更易传播,主要发生在废水处理厂和人体内部。瑞典查尔姆斯理工大学和哥德堡大学的数学科学系教授埃里克·克里斯蒂安松表示:“通过了解细菌抗药性的产生方式,我们可以更好地防止其传播。这对保护公共健康和医疗系统治疗感染的能力至关重要。” ...
UMI会附着于细胞内的DNA和RNA分子上,并开始复制。这个过程会产生唯一事件标识符UEI。每个UEI都是独一无二的,它们帮助确定每个基因分子的具体位置。相邻的UMI因相互作用频繁,产生的UEI也较多,这为计算模型提供了重建原始位置所需的信息,进而创建基因 ...
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